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Guillermo Valdés Castellanos desde 1994 es socio de GEA, Grupo de Economistas y Asociados, S.C. empresa consultora especializada en economía y política. Como socio director del área política –y desde 2103, también la de seguridad— ha desarrollado, entre otros proyectos, un modelo de análisis de la gobernabilidad para la generación de escenarios políticos, económicos y sociales, a nivel nacional y estatal. Ha desarrollado y dirigido estudios y proyectos sobre desarrollo social y político de varios estados de la república; diseño y desarrollo de modelos de análisis de riesgos; diseño y análisis de estudios de opinión pública y planes estratégicos de seguridad para estados y municipios.
Desde enero de 2007 hasta septiembre de 2011, dirigió el Centro de Investigación y Seguridad Nacional (CISEN). Como miembro del Consejo de Seguridad Nacional y del Gabinete de Seguridad Pública del gobierno de Felipe Calderón, tuvo bajo su responsabilidad importantes tareas, entre otras, la de coordinar ambas instancias en la generación de información para la elaboración de investigaciones, evaluaciones y escenarios estratégicos de las temas de la agenda de seguridad nacional. Además, junto con John Brennan, Asesor de Seguridad Nacional del presidente Barack Obama, coordinó el Grupo de Alto Nivel México-Estados Unidos en materia de cooperación para la seguridad.
Durante 2012, fue investigador de la Fundación Ortega y Gasset, con sede en Madrid, donde escribió el libro Historia del Narcotráfico en México, en el que analiza la relación entre crimen organizado, violencia e instituciones de seguridad y justicia. Fue publicado en 2013 por la editorial Aguilar. A la fecha ha vendido más de 30 mil ejemplares.
Su carrera profesional la inició en el sector público, donde trabajó en varias secretarías (Programación y Presupuesto, Desarrollo Social y Educación) y en la Presidencia de la República, dedicado básicamente a tareas de asesoría a los titulares de esas dependencias en materia de análisis y prospectiva política y de diseño de políticas públicas.
Es articulista del diario Milenio desde el año 2000 y sus artículos son publicados en diez ciudades del país.
Estudió la licenciatura de Ciencias Sociales en el Instituto Tecnológico Autónomo de México (ITAM).